摘要中医药的安全性与现代化是人类健康的重要关切。近年来部分中药使用引发的不良反应被频繁报道。尽管中药可能产生毒性反应但其在治疗多种复杂疾病中仍发挥关键作用因此中药毒性研究对安全用药至关重要。然而现有中药数据库主要聚焦药理作用对毒性关注不足既未区分方剂、中药、成分的毒性效应也未对特定毒性表型的靶点进行分类汇总更未整合前期研究证据。本研究构建了专注于中药毒性与安全用药的综合性数据库TCMToxDB系统整合并解析有毒中药的研究成果为用户提供多元信息获取与分析服务同时集成5种各具优势的经典中药-靶点、成分-靶点互作预测算法支持中药与成分的毒性靶点预测助力中药毒性研究并满足个性化需求。数据库访问地址https://www.sdu-idea.cn/TCMToxDBguoxian85gmail.com#中医药 #毒性 #数据库 #靶点预测 #毒性分析材料与方法TCMToxDB整体框架图1 TCMToxDB框架概览(A) TCMToxDB基础数据包含方剂、中药、成分、靶点的基础信息以及方剂-中药、中药-成分、中药-靶点、成分-靶点互作信息数据由MySQL存储。(B) 数据浏览与分析包含6个部分信息检索与浏览、数据下载、详情信息、毒性记录、关联网络分析、毒性靶点分析。(C) 毒性靶点预测TCMToxDB提供自动化流程的计算工具用于预测中药与成分的毒性靶点。数据来源与采集表1 TCMToxDB数据来源列出各类数据的类型、规模、来源及访问链接检索与浏览图2 TCMToxDB使用流程(A) 可通过拼音、汉字、拉丁名等关键词检索中药。(B) 浏览中药信息点击饼图扇区查看不同类型数据。(C) 详情页面摘要面板展示方剂、中药、成分、靶点的描述信息。(D) 中药相关毒性结果以列表形式提供对应文献描述与链接。(E) 中药-成分-靶点互作网络分析节点按来源组分着色鼠标悬停于节点可高亮节点及关联边并显示名称。(F) 毒性靶点分析TCMToxDB提供3种毒性靶点分析功能分别为毒性靶点分类统计、毒性靶点聚类、毒性靶点通路分析。(G) 毒性靶点预测TCMToxDB提供2类毒性靶点预测任务分别为中药毒性靶点预测、成分毒性靶点预测。结果与相关数据库的对比表2 中医药相关毒性数据库主要特征对比对比各数据库的核心特征与中医药毒性研究的关联实验设置表3 毒性靶点预测方法的训练数据展示中药功效、归经、药性成分SMILES靶点序列中药-靶点、成分-靶点互作的训练数据规模与使用情况中药毒性靶点预测表4 毒性靶点预测方法性能展示中药与成分毒性靶点预测任务中各算法的AUROC、AUPRC、F1值、精确率、召回率、特异性图3 基于HGNA-HTI预测的毒性靶点互作网络与富集分析(A) 由HGNA-HTI预测的毒性靶点-靶点互作网络节点大小与颜色对应度值与FDR值FDR值越小显著性越高。(B)(C) 分别展示FDR值更小的前20条富集KEGG通路与GO条目。成分毒性靶点预测图4 成分甲基丁香酚与DrugBAN预测的毒性靶点的最低结合能分子对接结果(A) 由DrugBAN预测的成分甲基丁香酚的毒性靶点PLAU、PTGS2、PHF14(B) 丁香酚-PLAU对接结果(C) 甲基丁香酚-PTGS2对接结果(D) 甲基丁香酚-PHF14对接结果。表5 成分甲基丁香酚与DrugBAN预测毒性靶点的分子对接结果列出每个靶点-成分对排名前5的结合能、空腔体积、中心坐标、对接尺寸详细总结思维导图数据来源预测算法性能对比现有数据库优势参考Database (Oxford). 2026 Jan 15:2026:baag019. doi: 10.1093/database/baag019.TCMToxDB: a comprehensive database for the toxicological analysis of traditional Chinese medicines260416TCMToxDB.pdf注AI辅助创作如有不当欢迎指出。内容仅供参考不构成任何建议。